Anders Carlsson har varit verksam vid Musikhögskolan och Högskolan för scen och musik vid Göteborgs universitet, bland annat som forskningssamordnare. Han har också varit chef för orgelforskningen vid GOArt och prefekt för HDK.
I sin forskning har han framför allt fokuserat på Göteborgs musikhistoria. I sin doktorsavhandling "Händel och Bacchus eller Händel och Bach?" kartlade han hur det professionella orkesterväsendet etablerades i Göteborg långt innan detsamma skedde i Stockholm.